物种间基因组注释质量

[alamin447]

件的最大熵为 n。仅保留表达基因中的节点 (TPM ≥ 1) 且总共至少有 10 个支持相关 AS 事件的读数。为了估计注释完整性的偏差，我们从（
/）通过早期器官发生（心脏的中期器官发生）的 RNA-seq 数据（前脑/大脑、后脑/小脑、心脏、肾脏、肝脏、卵巢和睾丸）对所有物种的转录区域进行详细的从头注释六种哺乳动物到成年。本研究使

用来自四个物种（人类、恒河猴、小鼠和鸡）的这些带Telegram 用户号码列表注释的转录本，以减轻差异造成的偏差。使用相同的量化过程来计算剪接复杂性。为了减轻测序深度的影响，每个样本都被下采样到相同的水平（鸡脑：37,033,946 个测序读数），然后量化剪接复杂性。终于， 具有不同特征的基因集 管家基因列表 (3,804) 从 Eisenberg 等人获得。(2013) [ 33 ]，以及其他不在列表中的蛋白质编码基因

被认为是非管家基因。基因分为两组：低表达（TPM < 50）和高表达（TPM ≥ 50）。使用公制 tau 测量六种组织的组织特异性[ 57 ]： τ=Σn我= 1( 1 −X我^）n − 1;X我^=X我最大_ _1≤i≤n _ _ _ _X我 X我 是基因在组织中的表达我 ,n 是组织的数量。 基因分为低组织特异性（tau < 0.3）和高组织特异性（tau ≥ 0.3）。基因年龄数据取自 Yin 等人。（2016）[ 58 ]。同样，基因被